Podczas całej historii klubowej mogliśmy zobaczyć cztery różne loga Villarrealu. Pierwsze logo powstało wraz z powstaniem klubu w 1923 roku, który nosił nazwę Club Deportivo Villarreal. Po dziewiętnastu latach klub zmienił nazwę na Club Atlético Foghetecaz, jednak po pięciu latach nazwa klubu ponownie uległą zmianie i tym razem klub przyjął nazwę CAF Villarreal. W 1954 roku zarząd zgodził zmienić się nazwę klubu z CAF Villarreal na nową nazwę Villarreal CF, wraz z tą zmianą ponownie ujrzeliśmy nowe logo. Nazwa klubu już nie ulegała zmianie jednak od sezonu 1966/1967 zostało zaprezentowane nowe logo, które funkcjonuje do dnia dzisiejszego.
Logo Villarreal w 1923 roku ( klub działał pod nazwą Club Deportivo Villarreal)
Logo Villarreal w 1942 roku ( klub działał pod nazwą CAF Villarreal)
Logo Villarreal od sezonu 1954/1955 ( klub zmienił nazwę na Villarreal CF)
Logo Villarreal od sezonu 1966/1967 ( klub odświeżył same logo, zmiana klubu nie uległa zmianie)
